Nur cemaatinin önde gelen isimlerinden olan Rotterdam İslam Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Ahmet Akgündüz, Cumhurbaşkanı Tayyip Erdoğan’ı sosyal medya hesabından eleştirdi. Cumhurbaşkanı Erdoğan’ın Mustafa Kemal Atatürk için “ortak değer”şeklindeki sözlerine tepki gösteren Ahmet Akgündüz, “Müslüman miletimizin kahir ekseriyetinin Mustafa Kemal'le problemi vardır” diye yazdı. Cumhurbaşkanı Erdoğan’a, “Cesaretiniz varsa, 5816 sayılı Kanunu kaldırın” diye seslenen Ahmet Akgündüz, Erdoğan’ın Atatürk’le ilgili sözlerinin yanlış olduğunu iddia etti. Ahmet Akgündüz’ün Cumhurbaşkanı Erdoğan’ı hedef alan açıklaması şöyle: AHMET AKGÜNDÜZ’Ü İÇİN KİM FETÖ İMASINDA BULUNMUŞTU Daha önce sosyal medya hesabından yaptığı açıklamada FETÖ gerekçesiyle üniversiteden atılan Nurcu’lara sahip çıkan Akgündüz, "Yeni KHK ile yine Nur taleberi ihrac edilmiş. Hükümet ayağına kurşun sıkıyor ve YÖK Nur talebelerini Fetöcülerden ayıramıyacak kadar basiretsiz davranıyor. Dost acı söyler." diye yazmıştı. Başkanlık referandumu öncesinde Hollanda’nın Aile ve Sosyal Politikalar Bakanı Fatma Betül Sayan Kaya’ya karşı tavrı nedeniyle başlayan kriz sonrasında, Ahmet Akgündüz’ün ismi gündeme gelmişti. Hükümete yakın isimlerden Ömer Turan, “Hollanda’da bir üniversitede Rektör olan Ahmet Akgündüz tüm dünyayı ayağa kaldıran gerilim hakkında hiç açıklama yapmamış, tavır koymamış” demişti. Ömer Turan, Twitter hesabından paylaştığı mesajlarda, Ahmet Akgündüz’ün başkanlığa karşı olduğunu iddia ederek Fethullah Gülen’e yakın isimlerden olduğunu ifade etmişti.